Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms