Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPGRIP1Q96KN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms