Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn16Q925N4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn16Q925N4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn16Q925N4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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