Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf3Q922U1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms