Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms