Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ8

Pcdhb22, Protocadherin beta 22, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb22Q91XZ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb22Q91XZ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms