Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gipc3Q8R5M0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc3Q8R5M0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms