Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms