Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2U2

Alkbh6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh6Q8K2U2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh6Q8K2U2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh6Q8K2U2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms