Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbrd1Q8K0B2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbrd1Q8K0B2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms