Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NELFCDQ8IXH7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms