Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ercc8Q8CFD5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ercc8Q8CFD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ercc8Q8CFD5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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