Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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