Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune1Q8BIW1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune1Q8BIW1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms