Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms