Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd1l2Q7TN88 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd1l2Q7TN88 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd1l2Q7TN88 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd1l2Q7TN88 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd1l2Q7TN88 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd1l2Q7TN88 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms