Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS2ST1Q7LGA3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms