Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6dQ76KF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6dQ76KF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms