Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r4Q6XJV4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms