Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms