Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms