Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Senp6Q6P7W0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp6Q6P7W0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp6Q6P7W0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms