Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc189Q6NZQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms