Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAQ7

Zzz3, ZZ-type zinc finger-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzz3Q6KAQ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zzz3Q6KAQ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zzz3Q6KAQ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms