Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms