Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms