Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms