Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms