Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spty2d1Q68FG3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms