Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms