Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb1i1Q62219 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb1i1Q62219 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1i1Q62219 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1i1Q62219 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1i1Q62219 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1i1Q62219 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1i1Q62219 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb1i1Q62219 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms