Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Erbb3Q61526 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Erbb3Q61526 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms