Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q5XFZ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5XFZ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms