Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms