Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim40Q3UWA4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim40Q3UWA4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms