Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yipf3Q3UDR8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms