Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms