Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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