Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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