Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam171bQ14CH0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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