Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf3ip1Q149C2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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