Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 PEX11YOL147C 711 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 HUT1YPL244C 1020 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YPR136CYPR136C 513 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 UBP14YBR058C 2346 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 LCB4YOR171C 1875 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 TRE2YOR256C 2430 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 STP2YHR006W 1626 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CCT7YJL111W 1653 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 TFC1YBR123C 1950 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SEC59YMR013C 1560 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 snR57snR57 88 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CLB3YDL155W 1284 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 RRP8YDR083W 1179 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YDR161WYDR161W 1164 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 TLG1YDR468C 675 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 BUD16YEL029C 939 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YFL051CYFL051C 483 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 AHP1YLR109W 531 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 RLP7YNL002C 969 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SPS4YOR313C 1017 nt3.1□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 ATP25YMR098C 1839 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 TEC1YBR083W 1461 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CIN8YEL061C 3003 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SEC15YGL233W 2733 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 TAM41YGR046W 1158 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 DOG2YHR043C 741 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 PCD1YLR151C 1023 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 PBA1YLR199C 831 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YNL320WYNL320W 855 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CYC2YOR037W 1101 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CTM1YHR109W 1758 nt3.09□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YPL109CYPL109C 1974 nt3.09□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 DBP7YKR024C 2229 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 KXD1YGL079W 657 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 SPO16YHR153C 597 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 COX19YLL018C-A 297 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YNL057WYNL057W 333 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 RFM1YOR279C 933 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 PCI8YIL071C 1335 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 EMP70YLR083C 2004 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 REC8YPR007C 2043 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 BCS1YDR375C 1371 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 TCB3YML072C 4638 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YGR237CYGR237C 2358 nt3.08□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 INP52YNL106C 3552 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YDR391CYDR391C 699 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 RPS21BYJL136C 264 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 MED11YMR112C 396 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YOR082CYOR082C 342 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 BNA4YBL098W 1383 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 SIN4YNL236W 2925 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YLR278CYLR278C 4026 nt3.07□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YDL162CYDL162C 357 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 PST1YDR055W 1335 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 TGL2YDR058C 981 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 AML1YGR001C 747 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 TIF4631YGR162W 2859 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YKR015CYKR015C 1707 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 DBP5YOR046C 1449 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 RAS1YOR101W 930 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YBR089WYBR089W 600 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 RAD2YGR258C 3096 nt3.06□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 CEX1YOR112W 2286 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 ATG13YPR185W 2217 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YDR442WYDR442W 393 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 RPS23AYGR118W 438 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YHR173CYHR173C 339 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 COQ9YLR201C 783 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 FLD1YLR404W 858 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 HUB1YNR032C-A 222 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 HMT1YBR034C 1047 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 RPS23BYPR132W 438 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 EBS1YDR206W 2655 nt3.05□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YLR416CYLR416C 399 nt3.04□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 GOT1YMR292W 417 nt3.04□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 ASI2YNL159C 870 nt3.04□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 UBP5YER144C 2418 nt3.04□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 JJJ1YNL227C 1773 nt3.04□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 SNQ2YDR011W 4506 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 ACA1YER045C 1470 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YDR340WYDR340W 303 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YGL101WYGL101W 648 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YGL214WYGL214W 486 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 GMH1YKR030W 822 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 SFH1YLR321C 1281 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YNL181WYNL181W 1224 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 YBR300CYBR300C 498 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 VPS17YOR132W 1656 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 MIP6YHR015W 1980 nt3.03□□□□□ -1.92
MSH5Q12175 TFC4YGR047C 3078 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 ABD1YBR236C 1311 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PMR1YGL167C 2853 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MBR1YKL093W 1020 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 RAD10YML095C 633 nt3.02□□□□□ -1.93
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