Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vps8Q0P5W1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms