Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLFN5Q08AF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms