Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms