Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SctQ08535 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SctQ08535 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SctQ08535 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SctQ08535 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SctQ08535 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SctQ08535 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SctQ08535 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SctQ08535 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SctQ08535 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SctQ08535 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SctQ08535 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SctQ08535 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SctQ08535 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SctQ08535 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SctQ08535 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms