Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NrepQ07475 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms