Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms