Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms