Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tff2Q03404 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms